Основным учебно-научным подразделением ТИ НИЯУ МИФИ является кафедра – объединение специалистов, ведущих одновременно педагогическую, методическую и научно-исследовательскую работу. Всего в институте семь кафедр:

-                   кафедра технологии машиностроения;

-                   кафедра технических систем контроля и управления;

-                   кафедра высшей математики;

-                   кафедра общей физики;

-                   кафедра информационных технологий и прикладной математики;

-                   кафедра социально-экономических дисциплин;

-                   кафедра экономики и управления.

Выпускающими являются кафедры экономики и управления, технических систем контроля и управления, технологии машиностроения, информационных технологий и прикладной математики. Выпускающие кафедры несут ответственность за качество подготовки студентов по реализуемым образовательным программам, разрабатывают с учебно-методическим управлением рабочие учебные планы, рабочие программы по дисциплинам направлений подготовки.

В структуру учебно-научных подразделений ТИ НИЯУ МИФИ также входят лаборатории по направлениям обучения, а, именно:

-                   лаборатории физики;

-                   лаборатория общеинженерных дисциплин;

-                   лаборатория электротехники;

-                   лаборатория цифровой и импульсной техники;

-                   лаборатория измерений физических величин;

-                   лаборатория электроники;

-                   учебно-производственный центр.